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プロテオーム受託解析
プロテオーム受託解析のキャンペーン
2024年6月28日まで 25％OFF キャンペーンを行います！
二次元電気泳動受託解析サービスについて
二次元電気泳動法は、タンパク質の2種類の性質をもとにし、異なる二段階の電気泳動操作を行ってタンパク質を分離する方法です。
当社の受託解析作業では、一次元目に固定化pH勾配ゲルストリップ(Immobiline DryStrip (GE Healthcare)など)を使用した等電点電気泳動によりタンパク質の等電点で分離し、二次元目はSDSポリアクリルアミドゲルによりタンパク質の分子量で分取する方法を用います。
一次元目に固定化pH勾配ゲルストリップを使用する事により、数千個のタンパク質をスポットとして高精度に分離する事が可能です。また、同一タンパク質であっても、翻訳後修飾（リン酸化など）の異なるタンパク質の分離・検出も可能です。二次元電気泳動実験で取得したSDSポリアクリルアミドゲルは、蛍光染色（SYPRO Ruby）を行う事により、微量なタンパク質のスポットも検出可能です。
数千個以上のタンパク質の変動は、専用の画像解析ソフトウェア（SameSpots）を使用し、2倍以上の変動しているタンパク質のスポット群を報告させて頂きます。また、全てのスポット群の変動状態の詳細を確認できるデジタルデータをお渡しします。
変動しているタンパク質に関しては、蛍光染色で僅かに検出されているタンパク質も同定する為に、LC-MS/MSによる質量分析解析を行います。LC-MS/MSの解析結果は、専用のソフトウェア（Scafford）を使用して詳細情報が確認できます。
当社は二次元電気泳動装置の販売メーカーでもあり、国内で300を超えるユーザー様の実験にご利用頂いており、多くのユーザー様のサンプル解析をサポートした実績があります。
プロテオーム受託解析の流れ
STEP1：受託解析のお申し込み
受託解析のご依頼は、WEB、メール などにて、ご連絡下さい。
担当者から受託解析の内容確認を、ご連絡させて頂きます。
サンプルの抽出条件から、ご相談させて頂きます。
有償にて、サンプル抽出作業を行う事も可能です。
当社でサンプル抽出を行う場合の組成は、7M Urea、2M Thiourea、32.5mM CAHPS、0.1M DTT、2.5％ Pharmalyte pH3－10 です。
タンパク濃度が低いサンプル、もしくは、脱塩処理が必要なサンプルに関しては、アセトン沈殿処理も行います。
論文などで報告されているサンプル抽出条件に合わせたい場合は、ご相談下さい。
STEP2：二次元電気泳動解析
二次元電気泳動実験は、一次元目の固定化pH勾配ゲルストリップのpH範囲条件（pH4~7 と pH3~10NL）と、二次元目のSDSポリアクリルアミドゲルの濃度条件（10.0％ と 12.5％）から選択して頂きます。初めて二次元電気泳動実験を行うサンプルに関しては、一次元目のpH範囲条件はpH4~7、二次元目の濃度条件は12.5％がお薦めです。
二次元電気泳動実験を行ったSDSポリアクリルアミドゲルは、SYPRO Ruby（蛍光染色液）にて染色を行いまして画像撮影を行います。
蛍光染色法は、微量なタンパク質スポットも検出可能で、質量分析解析でも良好な結果が得られます。
実験例：マウスの肝臓サンプル
サンプル調製方法：湿重量に対し4倍抽出液を加えて、超音波破砕を行い、遠心後の上清18µlを使用。
1次元目：18cm Immobiline DryStrip (GE Healthcare) pH4‐7
2次元目：12.5％ SDSポリアクリルアミドゲル
染色方法：SYPRO Ruby蛍光染色
画像解析作業は、二次元電気泳動画像解析ソフトウェア・SameSpots（Totallab社）を使用して解析作業を行います。
画像解析作業は、画像データの重ね合わせを行いスポットの位置を合わせて、スポットを検出します。
下図の右側の画像は、検出された2,012個のスポット群を表示しています。
画像解析の結果から、2倍以上変動しているスポット群を報告させて頂きます。
下図の左側は、2倍以上変動してるスポット群：261個の位置を表示しています。
報告書に添付しますデジタルメディアに、2倍以上変動しているスポット群の詳細情報が閲覧できるデジタル情報があります。
また、全てのスポットの詳細情報と、スポットの濃度などの数値情報（Excelデータ）をお渡しします。
受託解析の結果は、報告書、デジタルメディア、SDSポリアクリルアミドゲルをお渡しします。
SDSポリアクリルアミドゲル（蛍光染色）は、銀染色、または、CBB染色で再染色を行いますと可視化する事は可能です。
STEP3：質量分析解析
SDSポリアクリルアミドゲルから、目的スポットの回収作業を行いまして、ハイブリッドフーリエ変換LC-MS/MS Q Exactive(Thermo Scientific社)などの優れた質量精度を誇る質量分析装置にて行います。
使用機器が高感度なことにより、他社で結果が出なかったサンプルでも結果を出しております。
質量分析解析の結果は、Scaffoldソフトウェアを使用して、詳細情報が確認できます。
二次元電気泳動受託解析サービスの詳細
サンプル抽出作業費：￥5,000 ／ 1検体
※ タンパク濃度が低いサンプル、もしくは、脱塩処理が必要なサンプルに関しては、アセトン沈殿処理も行います。
pH4－7 もしくは pH3－10NL より選択
二次元目 … 10.0％、もしくは、12.5％ SDSポリアクリルアミドゲルより選択
染色方法 … SYPRO Ruby(蛍光染色)
撮影 … フルオロホレスター3000 (600万画素冷却CCDカメラ）
変動しているスポットの中から2倍以上の差異のあるスポット情報を報告します。
また、全てのスポットの画像解析結果のデジタルデータ(CD-ROMなど)を報告します。
感染性が疑われる場合には不活性処理を行ったサンプルを送付ください。
2024年 6月 28日まで、サンプル到着分までキャンペーン価格
質量分析 LC-MS/MSサービスの詳細
解析作業は米国にて行います。
スポット回収費：￥5,000 ／ 1スポット
※ 質量分析の受託解析はキャンペーン対象外です。
※ お問い合わせ等、記入頂いた個人情報は、細心の注意を払って厳重に管理いたします。
※ 本ページ上の情報は、Thermo Scientific社のホームページに掲載されている情報を引用しております。
※ カタログおよび、本ページ記載の定価には消費税は含まれておりません。